大约过了一刻钟，停职反省的费尔南多来了，作为大西班牙帝国在殖民地的军事长官，拉维扎列斯总督只能让他停职反省，却没有权力撤他的职务，因此，无论是冈萨雷斯及其手下，还是总督府的官差，无不立正敬礼。
矜持的费尔南多身穿一身戎装，对冈萨雷斯等人微微点了点头，把马克叫到一旁仔细盘问，忽然意识到，所有的案件全是西门阿尔梅达在暗中指使。于是，他下达命令，立刻释放沈琦等人，把总督府的官差暂时控制起来，让冈萨雷斯确保这里的安全，他带着朱辉和马克到费利佩家去调查情况。
没费什么事，就把陪同费利佩去过月港的商人找到了，费尔南多将军问起了有关刘谦和张彪的情况，这几个商人对此二人恨得咬牙切齿，听说这他俩假冒官差到了马尼拉，纷纷表示愿意到总督府去作证。
此刻，刘谦以明朝使者的身份，正在和拉维扎列斯总督进行谈判，呈上了巡抚衙门的正式文书，拿出了巡抚庞尚鹏的“亲笔”书信，并郑重承诺：只要马尼拉当局好好配合明朝官方办案，参照佛郎机人在澳门的待遇，允许西班牙人在月港建立租界，并开放漳州、泉州等口岸，允许他们自由贸易和传教。
拉维扎列斯曾经两次接待过明朝使者王望高，对官方文书和庞尚鹏的手迹并不陌生，通过总督府的师爷验证，加上西门阿尔梅达在暗中帮忙，便认可了刘谦的身份，谈判继续进行……
于是，刘谦给拉维扎列斯总督也开出了条件，请马尼拉当局帮忙，拘捕朝廷钦犯沈琦、汤景、月空长老及所谓九大护法，送到官船之上，交给明朝官府处置，其余人等全部赶进大海，任其自生自灭；拿出沈琦财产的三成，给拉维扎列斯总督作为报酬，其余的财物得让他们带走。
对于庞尚鹏的“承诺”和刘谦开出的条件，大大出乎拉维扎列斯总督的意料，他立刻全都答应了下来，因此，这场谈判进行得非常顺利。双方达成了协议之后，刘谦在总督府官差的陪同下，前往巴石河口岸码头去接管货场和商船，只等着西洋兵把那十二名“钦犯”送来，他们就可以溜之大吉。
当费尔南多将军带着证人来到了总督府时，刘谦等人早已经走了。不过，西门阿尔梅达神父还在和总督聊天，一看见气势汹汹的费尔南多等人，他忽然意识到百密一疏，没能及时把这几个商人给抓走，于是，便起身和拉维扎列斯告别，急匆匆离开了总督府。
拉维扎列斯总督听罢商人的哭诉，顿时大吃一惊，作为帝国派驻在殖民地的总督，他不敢乱来，立刻派人到码头去抓刘谦；与此同时，西门阿尔梅达回到寓所，就让仆人帮他收拾行装，他偷来的几本书和航海图藏在身上，带着仆人赶往巴石河口岸，现军方已经把那艘“明朝官船”给控制了，于是，他们慌忙跑进一座船坞，租了一条快艇，仓皇逃出了马尼拉。
在那艘“明朝官船”上，被吓成一滩烂泥的刘谦，倒在甲板上痛哭嚎啕，朱辉把俘虏查了一遍，现张彪不见了，于是，便蹲下身来，对刘谦好言劝慰，他这才讲了实话……
原来，被囚禁在南少林的刘谦静心修行，期待着庞尚鹏能早日把他放出来，一等就是一年多，渐渐地失去了耐心，忽然有一天，落为僧的张彪来找他，把他悄悄送到了玉枕洲，这时，他才知道，沈琦在月港的生意越做越大，开辟了一条从月港、马尼拉至新大陆的丝绸之路。
见此情景，万分失落的刘谦心中后悔不已，想去给沈琦当个账房先生，却遭到了张彪的耻笑，接着，他给刘谦出了个主意，如此这般、这般，便能重新索回失去的家产，并借机夺取沈琦在月港和马尼拉两地的生意。
经历了这么多年的养尊处优，刘谦早已不是唯唯诺诺的账房先生，听罢张彪之言，他立刻就动了心，经过张彪的一番精心设计，制定了一整套看似滴水不漏的行动方案，这才登上巡抚衙门的“官船”到了马尼拉。
听罢刘谦之言，似乎张彪是主谋，让朱辉无论如何不敢相信，于是，便问起了玄德真人、白海山和费利佩等人关押在何处？
刘谦顿时一愣，立刻停止了哭泣，摆着手表示，他和张彪刚刚抵达马尼拉，除了想报复沈琦，对绑架人质的事情一无所知，现在，只想回去找庞尚鹏请罪。
费尔南多将军判断，如果刘谦等人在马尼拉没有内应，断然不敢如此操作，因此，他坚信西门阿尔梅达就是幕后指使人，让朱辉颇为不解的是，这位神父和张彪之间，八竿子也打不着，又是如何建立的联系？
西班牙士兵在码头附近四处搜捕，最终抓到了张彪，让冈萨雷斯把他押到维托科鲁兹军营，由马克担任翻译，经过一番严厉的审讯，这才让他招了供……
原来，张彪辞官之后，知道接替他的宋河干不长，把家里的事处理完了，主动到少林寺落为僧，期待着田有才让他官复原职。
忽然有一天，有个商人悄悄来找到张彪，他误以为田有才要让他复职，便高高兴兴地到了厦门，田有才没急着见他，而是给了他一封书信，张彪看罢，就按照信中所述，就把刘谦接到了玉枕洲，使尽各种方法刺激他，再假装和他商量，最终制定了这个行动计划。
没过太久，来了一艘号称是巡抚衙门的官船，来接刘谦和张彪。当时，对于刘谦来说，他恨死了沈琦和朱辉等人，倘若借助西洋人之力，在海外干掉他们俩，重新夺回漳州月港等地的家产，就算把那些海外的财物全都送给西洋人，他都不会心疼；至于对西洋人的承诺，那还不是跟放屁一样，回来之后，就不必再当真，就算西洋人告到庞尚鹏那里，老庞还能拿自己的老丈人如何？
尽管张彪和刘谦的这两份供词，并不涉及西门阿尔梅达，但根据这位神父在谈判时的表现，拉维扎列斯总督对他产生了怀疑，想找他继续调查，却现他突然不辞而别，招致了总督大人勃然大怒，于是，便恢复了费尔南多的职权，派他负责侦破那三起失踪案，征得了佩雷斯大主教的同意，正式启动对西门阿尔梅达的调查……